Studi di trascrittomica nella leucemia mieloide cronica<\/h3><\/h1><\/span><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>Alterazione del comportamento di geni e pathways in pazienti con leucemia mieloide cronica dopo 12 mesi di terapia con Nilotinib<\/h4>\n<\/div>Descrizione<\/strong><\/p>\nLa leucemia mieloide cronica (LMC) \u00e8\u00a0relativamente rara<\/strong>\u00a0e in Italia colpisce circa 2 persone (2,4 per gli uomini e 1,8 per le donne) ogni 100.000 individui. La malattia ha un esordio in et\u00e0 avanzata, infatti l\u2019et\u00e0 media \u00e8 64 anni. La LMC \u00e8 una leucemia che colpisce le cellule staminali ematopoietiche che presentano numerose alterazioni nel DNA.<\/p>\nLa malattia \u00e8 caratterizzata dalla presenza nelle cellule tumorali del\u00a0cromosoma Philadelphia<\/strong>\u00a0che deriva dalla traslocazione reciproca dei cromosomi 9 e 22. Questa alterazione porta alla\u00a0formazione del\u00a0gene\u00a0BCR-ABL<\/strong>\u00a0che produce una\u00a0proteina\u00a0di fusione responsabile della crescita incontrollata delle cellule leucemiche.<\/p>\nIl progetto\u00a0PhilosoPhi34\u00a0<\/em>della Rete Ematologica Lombarda (REL) si \u00e8 svolto su un\u2019ampia casistica di pazienti (n=87) e ha compreso uno studio esplorativo di espressione genica delle cellule target CD34+\/lin- di 80 pazienti con leucemia mieloide cronica (LMC) alla diagnosi vs. le stesse cellule dopo 12 mesi di terapia con nilotinib.<\/p>\nIl piano sperimentale dello studio ha compreso la selezione delle cellule staminali CD34+\/lin- eseguita con la tecnologia di separazione magnetica con autoMACS Miltenyi. Le cellule CD34+\/lin-, le cellule CD34-\/lin- e le cellule Lin+ di ciascun paziente alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib (3, 6 e 12 mesi) sono state conservate in una biobanca dedicata in congelatore a -80\u00b0C nel Laboratorio di Ricerca. Abbiamo quindi condotto le analisi di microarray con GeneChip HTA 2.0 e tecnologia Affymetrix. I dati di microarray sono stati analizzati da un ingegnere bioinformatico che fa parte del team di ricercatori della Fondazione. Successivamente le analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019alterazione di espressione di geni e pathways (meccanismi biologici) nelle cellule leucemiche alla diagnosi rispetto a 12 mesi di trattamento con nilotinib.<\/p>\n
Destinatari<\/strong><\/p>\nIl progetto di ricerca \u00e8 uno studio traslazionale volto a identificare \u201cl\u2019impronta genetica\u201d dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib, per determinare i pazienti che rispondono alla terapia e quelli che invece sono resistenti. I risultati dello studio sono volti a fornire indicazioni utili per terapie personalizzate per ciascun paziente.<\/p>\n
Obiettivi\u00a0<\/strong><\/p>\nL\u2019obiettivo principale, conseguito con analisi di espressione genica con la tecnologia Affymetrix, \u00e8 identificare i cambiamenti di espressione genica e dei meccanismi biomolecolari delle cellule leucemiche dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib.<\/p>\n
Durata\u00a0<\/strong><\/p>\nIl progetto \u00e8 iniziato nel 2013 e studi di correlazione tra i geni differentemente espressi alla diagnosi vs. 12 mesi di trattamento vs. soggetti sani e le caratteristiche cliniche dei pazienti sono in corso. Inoltre, analisi genetiche hanno messo in luce geni che potrebbero essere coinvolti nei processi molecolari correlati agli effetti collaterali del farmaco e sono in corso approfondimenti e correlazioni con i dati clinici dei pazienti.<\/p>\n
Il progetto PhilosoPhi34 \u00e8 stato realizzato anche grazie ad alcune strumentazioni della Fondazione presenti nel Laboratorio di ricerca quali la strumentazione Affymetrix, strumento Nanodrop per la quantificazione degli acidi nucleici, tecnologia GeneAmp PCR System 9700.<\/p>\n
<\/p>\n
Risultati <\/strong><\/p>\nLe analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019espressione aumentata di geni appartenenti principalmente al ciclo cellulare, ai trasportatori di membrana ATP-binding cassette (ABC) e al pathway JAK-STAT. In particolare, i geni del ciclo cellulare decidono il destino della cellula e il fatto che siano meno espressi dopo la terapia suggerisce che il nilotinib abbia favorito la morte delle cellule leucemiche.<\/p>\n
I geni trasportatori di membrana controllano l\u2019estromissione dei farmaci o altre molecole fuori dalla cellula e la loro alterazione potrebbe giocare un ruolo importante nella resistenza al trattamento.<\/p>\n
Infine, il pathway JAK-STAT \u00e8 uno dei principali meccanismi volto a innescare, con un fenomeno \u201ca cascata\u201d, il reclutamento di altri geni e pathways che controllano e modulano l\u2019espressione di geni cruciali per la proliferazione, sopravvivenza e morte cellulare. La diminuzione della loro espressione dopo nilotinib potrebbe suggerire che il farmaco ha avuto effetto sul controllo della sopravvivenza delle cellule leucemiche.<\/p>\n
<\/p>\n
Pubblicazioni<\/strong><\/p>\n\n- Occurrence of L1M Elements in Chromosomal Rearrangements Associated to Chronic Myeloid Leukemia (CML): Insights from Patient-Specific Breakpoints Characterization.<\/a>
\nAlberto L\u2019Abbate, Vittoria Moretti, Ester Pungolino, Giovanni Micheloni, Roberto Valli, Annalisa Frattini, Matteo Barcella, Francesco Acquati, Rolland A Reinbold, Lucy Costantino, Fulvio Ferrara, Alessandra Trojani, Mario Ventura, Giovanni Porta and Roberto Cairoli. Genes<\/strong><\/em>\u00a02023,\u00a014<\/em>(7), 1351;\u00a0<\/strong><\/li>\n- Nilotinib-induced bone marrow CD34+\/lin-Ph+ cells early clearance in newly diagnosed CP-Chronic Myeloid Leukemia: Final report of the PhilosoPhi34 study.<\/a> Pungolino E, D’adda M, De Canal G,\u00a0Trojani A, Perego A, Elena C, Lunghi F, Turrini M, Borin L, Iurlo A, Latargia ML, Carraro MC, Spina F, Artale S, Anghilieri M, Molteni A, Caramella M, Baruzzo G, Nichelatti M, Di Camillo B, Cairoli R. Eur J Haematol. 2021 Oct;107(4):436-448. doi: 10.1111\/ejh.13680. Epub 2021 Jul 6.<\/strong><\/li>\n
- Nilotinib interferes with cell cycle, ABC transporters and JAK-STAT signaling pathway in CD34+\/lin- cells of patients with chronic phase chronic myeloid leukemia after 12 months of treatment.<\/a> Trojani A, Pungolino E, Dal Molin A, Lodola M, Rossi G, D’Adda M, Perego A, Elena C, Turrini M, Borin L, Bucelli C, Malato S, Carraro MC, Spina F, Latargia ML, Artale S, Spedini P, Anghilieri M, Di Camillo B, Baruzzo G, De Canal G, Iurlo A, Morra E, Cairoli R. PLoS One. 2019 Jul 18;14(7):e0218444. doi: 10.1371\/journal.pone.0218444. eCollection 2019.<\/strong><\/li>\n
- Nilotinib induced bone marrow CD34+\/lin-Ph+ cells early clearance in newly diagnosed CP-chronic myeloid leukemia.<\/a> Pungolino E, Rossi G, De Canal G,\u00a0Trojani A, D’adda M, Perego A, Orlandi EM, Lunghi F, Turrini M, Borin L, Iurlo A, Latargia ML, Carraro MC, Spina F, Lodola M, Artale S, Anghilieri M, Spedini P, Cantoni S, Di Camillo B, Morra E, Cairoli R. Am J Hematol. <\/strong>2018 Jul;93(7):E162-E164. doi: 10.1002\/ajh.25106. Epub 2018 May 17.<\/strong><\/li>\n
- Wide-transcriptome analysis and cellularity of bone marrow CD34+\/lin- cells of patients with chronic-phase chronic myeloid leukemia at diagnosis vs. 12 months of first-line nilotinib treatment.<\/a> Trojani A, Pungolino E, Rossi G, D’Adda M, Lodola M, Camillo BD, Perego A, Turrini M, Orlandi E, Borin L, Iurlo A, Malato S, Spina F, Latargia ML, Lanza F, Artale S, Anghilieri M, Carraro MC, Canal G, Morra E, Cairoli R. Cancer Biomark. 2017 Dec 12;21(1):41-53. doi: 10.3233\/CBM-170209.<\/strong><\/li>\n<\/ol>\n<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>
![](\"https:\/\/www.malattiedelsangue.org\/fms\/wp-content\/uploads\/2021\/09\/philosofy-400x181.png\" "\\"philosofy\\"")
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Alterazione del comportamento di geni e pathways in pazienti con leucemia mieloide cronica dopo 12 mesi di terapia con Nilotinib<\/h4>\n<\/div>Descrizione<\/strong><\/p>\nLa leucemia mieloide cronica (LMC) \u00e8\u00a0relativamente rara<\/strong>\u00a0e in Italia colpisce circa 2 persone (2,4 per gli uomini e 1,8 per le donne) ogni 100.000 individui. La malattia ha un esordio in et\u00e0 avanzata, infatti l\u2019et\u00e0 media \u00e8 64 anni. La LMC \u00e8 una leucemia che colpisce le cellule staminali ematopoietiche che presentano numerose alterazioni nel DNA.<\/p>\nLa malattia \u00e8 caratterizzata dalla presenza nelle cellule tumorali del\u00a0cromosoma Philadelphia<\/strong>\u00a0che deriva dalla traslocazione reciproca dei cromosomi 9 e 22. Questa alterazione porta alla\u00a0formazione del\u00a0gene\u00a0BCR-ABL<\/strong>\u00a0che produce una\u00a0proteina\u00a0di fusione responsabile della crescita incontrollata delle cellule leucemiche.<\/p>\nIl progetto\u00a0PhilosoPhi34\u00a0<\/em>della Rete Ematologica Lombarda (REL) si \u00e8 svolto su un\u2019ampia casistica di pazienti (n=87) e ha compreso uno studio esplorativo di espressione genica delle cellule target CD34+\/lin- di 80 pazienti con leucemia mieloide cronica (LMC) alla diagnosi vs. le stesse cellule dopo 12 mesi di terapia con nilotinib.<\/p>\nIl piano sperimentale dello studio ha compreso la selezione delle cellule staminali CD34+\/lin- eseguita con la tecnologia di separazione magnetica con autoMACS Miltenyi. Le cellule CD34+\/lin-, le cellule CD34-\/lin- e le cellule Lin+ di ciascun paziente alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib (3, 6 e 12 mesi) sono state conservate in una biobanca dedicata in congelatore a -80\u00b0C nel Laboratorio di Ricerca. Abbiamo quindi condotto le analisi di microarray con GeneChip HTA 2.0 e tecnologia Affymetrix. I dati di microarray sono stati analizzati da un ingegnere bioinformatico che fa parte del team di ricercatori della Fondazione. Successivamente le analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019alterazione di espressione di geni e pathways (meccanismi biologici) nelle cellule leucemiche alla diagnosi rispetto a 12 mesi di trattamento con nilotinib.<\/p>\n
Destinatari<\/strong><\/p>\nIl progetto di ricerca \u00e8 uno studio traslazionale volto a identificare \u201cl\u2019impronta genetica\u201d dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib, per determinare i pazienti che rispondono alla terapia e quelli che invece sono resistenti. I risultati dello studio sono volti a fornire indicazioni utili per terapie personalizzate per ciascun paziente.<\/p>\n
Obiettivi\u00a0<\/strong><\/p>\nL\u2019obiettivo principale, conseguito con analisi di espressione genica con la tecnologia Affymetrix, \u00e8 identificare i cambiamenti di espressione genica e dei meccanismi biomolecolari delle cellule leucemiche dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib.<\/p>\n
Durata\u00a0<\/strong><\/p>\nIl progetto \u00e8 iniziato nel 2013 e studi di correlazione tra i geni differentemente espressi alla diagnosi vs. 12 mesi di trattamento vs. soggetti sani e le caratteristiche cliniche dei pazienti sono in corso. Inoltre, analisi genetiche hanno messo in luce geni che potrebbero essere coinvolti nei processi molecolari correlati agli effetti collaterali del farmaco e sono in corso approfondimenti e correlazioni con i dati clinici dei pazienti.<\/p>\n
Il progetto PhilosoPhi34 \u00e8 stato realizzato anche grazie ad alcune strumentazioni della Fondazione presenti nel Laboratorio di ricerca quali la strumentazione Affymetrix, strumento Nanodrop per la quantificazione degli acidi nucleici, tecnologia GeneAmp PCR System 9700.<\/p>\n
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Risultati <\/strong><\/p>\nLe analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019espressione aumentata di geni appartenenti principalmente al ciclo cellulare, ai trasportatori di membrana ATP-binding cassette (ABC) e al pathway JAK-STAT. In particolare, i geni del ciclo cellulare decidono il destino della cellula e il fatto che siano meno espressi dopo la terapia suggerisce che il nilotinib abbia favorito la morte delle cellule leucemiche.<\/p>\n
I geni trasportatori di membrana controllano l\u2019estromissione dei farmaci o altre molecole fuori dalla cellula e la loro alterazione potrebbe giocare un ruolo importante nella resistenza al trattamento.<\/p>\n
Infine, il pathway JAK-STAT \u00e8 uno dei principali meccanismi volto a innescare, con un fenomeno \u201ca cascata\u201d, il reclutamento di altri geni e pathways che controllano e modulano l\u2019espressione di geni cruciali per la proliferazione, sopravvivenza e morte cellulare. La diminuzione della loro espressione dopo nilotinib potrebbe suggerire che il farmaco ha avuto effetto sul controllo della sopravvivenza delle cellule leucemiche.<\/p>\n
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Pubblicazioni<\/strong><\/p>\n\n- Occurrence of L1M Elements in Chromosomal Rearrangements Associated to Chronic Myeloid Leukemia (CML): Insights from Patient-Specific Breakpoints Characterization.<\/a>
\nAlberto L\u2019Abbate, Vittoria Moretti, Ester Pungolino, Giovanni Micheloni, Roberto Valli, Annalisa Frattini, Matteo Barcella, Francesco Acquati, Rolland A Reinbold, Lucy Costantino, Fulvio Ferrara, Alessandra Trojani, Mario Ventura, Giovanni Porta and Roberto Cairoli. Genes<\/strong><\/em>\u00a02023,\u00a014<\/em>(7), 1351;\u00a0<\/strong><\/li>\n- Nilotinib-induced bone marrow CD34+\/lin-Ph+ cells early clearance in newly diagnosed CP-Chronic Myeloid Leukemia: Final report of the PhilosoPhi34 study.<\/a> Pungolino E, D’adda M, De Canal G,\u00a0Trojani A, Perego A, Elena C, Lunghi F, Turrini M, Borin L, Iurlo A, Latargia ML, Carraro MC, Spina F, Artale S, Anghilieri M, Molteni A, Caramella M, Baruzzo G, Nichelatti M, Di Camillo B, Cairoli R. Eur J Haematol. 2021 Oct;107(4):436-448. doi: 10.1111\/ejh.13680. Epub 2021 Jul 6.<\/strong><\/li>\n
- Nilotinib interferes with cell cycle, ABC transporters and JAK-STAT signaling pathway in CD34+\/lin- cells of patients with chronic phase chronic myeloid leukemia after 12 months of treatment.<\/a> Trojani A, Pungolino E, Dal Molin A, Lodola M, Rossi G, D’Adda M, Perego A, Elena C, Turrini M, Borin L, Bucelli C, Malato S, Carraro MC, Spina F, Latargia ML, Artale S, Spedini P, Anghilieri M, Di Camillo B, Baruzzo G, De Canal G, Iurlo A, Morra E, Cairoli R. PLoS One. 2019 Jul 18;14(7):e0218444. doi: 10.1371\/journal.pone.0218444. eCollection 2019.<\/strong><\/li>\n
- Nilotinib induced bone marrow CD34+\/lin-Ph+ cells early clearance in newly diagnosed CP-chronic myeloid leukemia.<\/a> Pungolino E, Rossi G, De Canal G,\u00a0Trojani A, D’adda M, Perego A, Orlandi EM, Lunghi F, Turrini M, Borin L, Iurlo A, Latargia ML, Carraro MC, Spina F, Lodola M, Artale S, Anghilieri M, Spedini P, Cantoni S, Di Camillo B, Morra E, Cairoli R. Am J Hematol. <\/strong>2018 Jul;93(7):E162-E164. doi: 10.1002\/ajh.25106. Epub 2018 May 17.<\/strong><\/li>\n
- Wide-transcriptome analysis and cellularity of bone marrow CD34+\/lin- cells of patients with chronic-phase chronic myeloid leukemia at diagnosis vs. 12 months of first-line nilotinib treatment.<\/a> Trojani A, Pungolino E, Rossi G, D’Adda M, Lodola M, Camillo BD, Perego A, Turrini M, Orlandi E, Borin L, Iurlo A, Malato S, Spina F, Latargia ML, Lanza F, Artale S, Anghilieri M, Carraro MC, Canal G, Morra E, Cairoli R. Cancer Biomark. 2017 Dec 12;21(1):41-53. doi: 10.3233\/CBM-170209.<\/strong><\/li>\n<\/ol>\n<\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/span><\/div><\/div><\/div><\/div><\/i>0<\/span> persone colpite<\/span><\/div>ogni 100.000 individui<\/div><\/div><\/div><\/i>0<\/span>.0M<\/span><\/div>Impegno annuo <\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div><\/div>
Descrizione<\/strong><\/p>\n La leucemia mieloide cronica (LMC) \u00e8\u00a0relativamente rara<\/strong>\u00a0e in Italia colpisce circa 2 persone (2,4 per gli uomini e 1,8 per le donne) ogni 100.000 individui. La malattia ha un esordio in et\u00e0 avanzata, infatti l\u2019et\u00e0 media \u00e8 64 anni. La LMC \u00e8 una leucemia che colpisce le cellule staminali ematopoietiche che presentano numerose alterazioni nel DNA.<\/p>\n La malattia \u00e8 caratterizzata dalla presenza nelle cellule tumorali del\u00a0cromosoma Philadelphia<\/strong>\u00a0che deriva dalla traslocazione reciproca dei cromosomi 9 e 22. Questa alterazione porta alla\u00a0formazione del\u00a0gene\u00a0BCR-ABL<\/strong>\u00a0che produce una\u00a0proteina\u00a0di fusione responsabile della crescita incontrollata delle cellule leucemiche.<\/p>\n Il progetto\u00a0PhilosoPhi34\u00a0<\/em>della Rete Ematologica Lombarda (REL) si \u00e8 svolto su un\u2019ampia casistica di pazienti (n=87) e ha compreso uno studio esplorativo di espressione genica delle cellule target CD34+\/lin- di 80 pazienti con leucemia mieloide cronica (LMC) alla diagnosi vs. le stesse cellule dopo 12 mesi di terapia con nilotinib.<\/p>\n Il piano sperimentale dello studio ha compreso la selezione delle cellule staminali CD34+\/lin- eseguita con la tecnologia di separazione magnetica con autoMACS Miltenyi. Le cellule CD34+\/lin-, le cellule CD34-\/lin- e le cellule Lin+ di ciascun paziente alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib (3, 6 e 12 mesi) sono state conservate in una biobanca dedicata in congelatore a -80\u00b0C nel Laboratorio di Ricerca. Abbiamo quindi condotto le analisi di microarray con GeneChip HTA 2.0 e tecnologia Affymetrix. I dati di microarray sono stati analizzati da un ingegnere bioinformatico che fa parte del team di ricercatori della Fondazione. Successivamente le analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019alterazione di espressione di geni e pathways (meccanismi biologici) nelle cellule leucemiche alla diagnosi rispetto a 12 mesi di trattamento con nilotinib.<\/p>\n Destinatari<\/strong><\/p>\n Il progetto di ricerca \u00e8 uno studio traslazionale volto a identificare \u201cl\u2019impronta genetica\u201d dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib, per determinare i pazienti che rispondono alla terapia e quelli che invece sono resistenti. I risultati dello studio sono volti a fornire indicazioni utili per terapie personalizzate per ciascun paziente.<\/p>\n Obiettivi\u00a0<\/strong><\/p>\n L\u2019obiettivo principale, conseguito con analisi di espressione genica con la tecnologia Affymetrix, \u00e8 identificare i cambiamenti di espressione genica e dei meccanismi biomolecolari delle cellule leucemiche dei pazienti con LMC alla diagnosi e dopo terapia con nilotinib.<\/p>\n Durata\u00a0<\/strong><\/p>\n Il progetto \u00e8 iniziato nel 2013 e studi di correlazione tra i geni differentemente espressi alla diagnosi vs. 12 mesi di trattamento vs. soggetti sani e le caratteristiche cliniche dei pazienti sono in corso. Inoltre, analisi genetiche hanno messo in luce geni che potrebbero essere coinvolti nei processi molecolari correlati agli effetti collaterali del farmaco e sono in corso approfondimenti e correlazioni con i dati clinici dei pazienti.<\/p>\n Il progetto PhilosoPhi34 \u00e8 stato realizzato anche grazie ad alcune strumentazioni della Fondazione presenti nel Laboratorio di ricerca quali la strumentazione Affymetrix, strumento Nanodrop per la quantificazione degli acidi nucleici, tecnologia GeneAmp PCR System 9700.<\/p>\n <\/p>\n Risultati <\/strong><\/p>\n Le analisi genetiche hanno messo in luce l\u2019espressione aumentata di geni appartenenti principalmente al ciclo cellulare, ai trasportatori di membrana ATP-binding cassette (ABC) e al pathway JAK-STAT. In particolare, i geni del ciclo cellulare decidono il destino della cellula e il fatto che siano meno espressi dopo la terapia suggerisce che il nilotinib abbia favorito la morte delle cellule leucemiche.<\/p>\n I geni trasportatori di membrana controllano l\u2019estromissione dei farmaci o altre molecole fuori dalla cellula e la loro alterazione potrebbe giocare un ruolo importante nella resistenza al trattamento.<\/p>\n Infine, il pathway JAK-STAT \u00e8 uno dei principali meccanismi volto a innescare, con un fenomeno \u201ca cascata\u201d, il reclutamento di altri geni e pathways che controllano e modulano l\u2019espressione di geni cruciali per la proliferazione, sopravvivenza e morte cellulare. La diminuzione della loro espressione dopo nilotinib potrebbe suggerire che il farmaco ha avuto effetto sul controllo della sopravvivenza delle cellule leucemiche.<\/p>\n <\/p>\n Pubblicazioni<\/strong><\/p>\n\n
\nAlberto L\u2019Abbate, Vittoria Moretti, Ester Pungolino, Giovanni Micheloni, Roberto Valli, Annalisa Frattini, Matteo Barcella, Francesco Acquati, Rolland A Reinbold, Lucy Costantino, Fulvio Ferrara, Alessandra Trojani, Mario Ventura, Giovanni Porta and Roberto Cairoli. Genes<\/strong><\/em>\u00a02023,\u00a014<\/em>(7), 1351;\u00a0<\/strong><\/li>\n<\/span><\/div>